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O Departamento de Ensino da AME-SP objetiva esclarecer, divulgar e expandir o movimento médico-espírita entre profissionais da saúde, no meio espírita e na sociedade em geral. Busca promover estudos, cursos, seminários, congressos e publicações, além de apoiar pesquisas que integrem Espiritismo e ciência. A instituição analisa práticas de assistência espiritual voltadas ao auxílio na cura física, mental e espiritual, favorecendo a educação integral do ser humano. Por fim, visa difundir a espiritualidade como ferramenta na prática clínica, fortalecendo sua presença em universidades, sociedades médicas e na sociedade em geral.